Vatnsberinn Evol

12.000 árum eftir atburði Sousei no Aquarion er mannkyninu ógnað af nýjum óvin frá öðrum víddum sem merktur er „Ræningjar“, sem rétt eins og Skuggienglarnir ráðast á borgir manna til að ræna íbúum þess. Til að verja mannkynið frá þessari innrás stofnuðu Neo-DEAVA samtökin tvö teymi, eitt skipað karlmönnum og annað aðeins kvenkyns, hvert um sig að stjórna risavélum sínum sem kallast „Aquaria“. Til að vernda nýja vin sinn Mikono ákvað unglingurinn Amata Sora að nota kraftana sem hann hefur haldið leyndu allt sitt líf og með því að sameina Vectors og karlkyns og kvenkyns flugmenn í eitt vélmenni endurfæðist goðsagnakenndi risinn Aquarion enn einu sinni.