Yfirlit
Sagan gerist í fjarlægri framtíð. Landið er eyðilagt og mannkynið stofnar farsíma virkisborgina Plantation. Flugmenn sem framleiddir eru á Plantation búa í Mistilteinn, einnig þekktir sem „fuglabúr“. Börn búa þar og vita ekkert um umheiminn eða frelsi himins. Líf þeirra samanstendur af því að berjast við að sinna verkefnum. Óvinir þeirra eru dularfull risastór lífsform sem þekkt eru sem Kyōryū og börnin stjórna vélmennum sem kallast Franxx til að horfast í augu við þau. Fyrir börnin sannar tilvist þeirra að hjóla á Franxx.
Drengur að nafni Hiro er kallaður Code: 016, og hann var einu sinni þekktur sem undrabarn. Hann hefur hins vegar lent undir og tilvist hans virðist óþörf. Að stjórna ekki Franxx er það sama og að hætta að vera til. Dag einn birtist fyrir honum dularfull stúlka þekkt sem „Zero Two“. Tvö horn vaxa úr höfði hennar.